1月21日到2006年9月14日，对应了第三世代游戏，后半段故事背景转移到对战开拓区，与游戏中不同的是，对战开
拓区位在关都地区的各地而不是丰缘地区。共计191话（总集篇及未播放集数除外）。
钻石珍珠：从2006年9月28日到2010年9月9日，对应了第四世代游戏。共计191话（包括2个特别篇，总集篇除外）。
超级愿望：从2010年9月23日到2013年9月26日，分为两季四章。2010年9月23日～2012年6月14日为超级愿望篇，2012年6月21日～2013
年1月10日为超级愿望第二季，2013年1月17日～2013年4月18日为超级愿望第二季N章，2013年4月25日～2013年9月26日是超级愿望第二季
Da!章。超级愿望篇对应黑版／白版，第二季对应黑白2，N章则是根据游戏中的剧情，改编了与等离子队相关的内容。Da!章为原创内容。
共计144话（包括2个特别篇，未播放集数除外）。
XY：从2013年10月17日开始，对应了第六世代游戏，分为两季。
太阳月亮：从2016年11月17日开始播放，对应了第七世代游戏。
……
电影：神奇宝贝电影自1998年起以每年一部的速度上映，上映时间都在暑假期间。故事以传说的神奇宝贝为主。为了故事的连贯性，每
部电影上映的时候，小智的伙伴们与手持的神奇宝贝都与当时播放的电视动画保持一致。另外在前六部电影正式放映前，都会播放一段皮
卡丘短片，之后取消了这个设定，但是从酋雷姆VS圣剑士凯路迪欧起又恢复了这个设定。从幻影的霸者索罗亚克开始，台湾地区开始
与日本同步上映。
无印篇：
1.超梦的逆袭
2.梦幻的神奇宝贝洛奇亚爆诞3.结晶塔之帝王
4.雪拉比穿梭时空的相遇
5.水都的守护神拉帝亚斯与拉帝欧斯
超世代：
6.七夜的许愿星基拉祈
7.裂空的访问者代欧奇希斯
8.梦幻与波导的勇者路卡利欧
9.神奇宝贝保育家与苍海的王子玛纳霏
钻石珍珠：
10.帝牙卢卡VS帕路奇犽VS达克莱伊
11.骑拉帝纳与冰空的花束洁咪
12.阿尔宙斯超克的时空
13.幻影的霸者索罗亚克
超级愿望：
14.比克提尼与黑英雄捷克罗姆/白英雄雷希拉姆
15.酋雷姆VS圣剑士凯路迪欧
16.神速的盖诺赛克特超梦觉醒
XYZ：
17.破坏之茧与蒂安希
18.光环の超魔神胡帕
19.波尔凯尼恩与机关人偶玛机雅娜
……
小栏目：动画最开始播放的时候并没有小栏目，从华蓝
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